涉及魚類產卵場等生態，論證范圍可不限于水功能區。未劃分水功能區的水域，入河排污口影響范圍內的水域都應為論證范圍。

論證應在現場查勘、調查和收集建設項目及相關區域基本資料和補充監測的基礎上，充分考慮入河排污口設置的初步方案，采用數學模型模擬的方法，預測入河廢污水在設計水文條件下對水功能區（水域）的影響及范圍，論證入河排污口設置的合理性，提出設置入河排污口的建議。